کتاب «موسوعه آیات الأحکام » تحقیق آیاتی است که در بر دارنده احکام فقهی است و همچنین اقوال و فتاوای فقهای شیعه و اهل تسنن در این زمینه را مورد بررسی قرار می‌دهد.

در هر مبحث، بعد از ذکر آیه‌ای از آیات الأحکام که حاوی حکم و یا احکامی در موضوع تحقیق می‌باشد، امور ذیل مورد بررسی قرار می‌گیرد:

• ذکر معانی لغوی کلمات آیه، با استناد به کتب معتبر لغوی و نیز اختصاراً اشاره به مباحث نحوی
• ذکر شأن نزول آیات قبل از ورود به دیگر مباحث مربوطه، در صورتی که برای آیه، شأن نزول بیان شده باشد.
• تفسیر و تبیین مفهوم آیه، با استفاده از تفاسیر مشهور و معروف شیعه و اهل سنّت.
• بیان احکام مستفاد از آیه.